實驗室表型成像系統——LAB SCANALYZER
日期:2018-02-02 13:14:44

實驗室表型成像系統LAB SCANALYZER

blob.png

Lab Scanalyzer 頂部成像版本(左框:柜式版本;右框:臺式版本)



實驗室植物表型成像系統——Lab ScanalyzerScanalyzer系列中的一個版本,可進行可見光(VIS)成像。攝像頭固定,沒有傳送裝置,通過手工更換樣品,測量較小的樣品。Lab Scanalyzer有兩個不同版本,一個版本為頂部成像版本,另一個為頂部及側面成像版本。其中頂部成像版本分為柜式和臺式兩種,以用于不同高度植物的表型研究。可對小盆植株、用多孔板培養的植物、多孔板里的葉圓片、植物的種子,也可以對細菌、小型動物、蟲卵等進行表型成像測量,進行各種研究。

實驗室表型成像系統Lab Scanalyzer是一個多功能的成像柜,設計用于植物和小型生物體的低成本表型分析。在標準配置中,一個RGB傳感器與照明系統一起安裝在機柜的頂部(底部照明可供選用)成像機柜有立柜式與臺式兩種規格。Lab Scanalyzer適用于表型測試,如生長研究、測試對壓力和環境因素的表型反應、萌發測定或生態毒理學測試。系統提供形態測量參數的測量,包括:葉面積、葉周長、偏心率、圓度;、圓直徑、中等葉寬指數、密實度、凸面區域面積、質心等參數。軟件可以從RGB相機或任何CCD或高光譜相機的照片或視頻中測量葉片大小或蓮座葉直徑。


實驗室成像系統Lab Scanalyzer RGB成像還可以完成:

?  植物適應性評估中的顏色分割

?  計算葉片生長相對速率

?  整個實驗期間葉面積差異的比較

?  綠化指數

?  顏色分割后的各種顏色對表征的貢獻


除了上面提到的標準配置,Lab Scanalyzer也新增了頂視-側視版本。該版本特別用于高達40cm盆栽植物(盆直徑40cm)表型成像,包含一個自上而下的鏡頭和一個水平鏡頭,可以從各個方面拍攝樣品圖像。

blob.png


主要功能

l  對植物等小型樣品進行可見光頂部成像或頂部+側面成像

l  通過可見光成像可以測量植物的結構、寬度、密度、對稱性、葉長、葉寬、葉面積、葉顏色、

葉病斑、種子顏色、種子顏色面積等多個參數

l  可適用 96 孔板高精度測量     

l  進行動物/昆蟲的游動/運動測試時,可自動獲取圖像

應用領域

植物生理學、農業科學、植物病理學、遺傳育種、突變株篩選、植物形態建模、種子生理學、種子病理學、植物脅迫生理學、植物水力學、毒理學等研究領域。


技術規格

樣本類型

·                       在盆或小盤子的植物,例如擬南芥、小型水稻、花卉等

·                       在多孔板或培養皿中的樣品,例如種子、葉片、浮萍、幼蟲等

·                       植物部分組織,例如葉子,果實等

成像

可見光頂部成像或可見光頂部+側面成像

8百萬像素,35mm鏡頭,29°/ 21°視角;

照明

頂部或底部或頂部和側面

外形尺寸

臺式版本:600 mm x 600 mm x 1128.5 mm

立柜式版本:600 mm x 600 mm x 1750 mm

頂視-側視版本:2059 mm x 660 mm x 1290 mm

內部空間

臺式版本:約410mm×480mm的樣本成像面積(底部距相機550mm的距離)

立柜式版本:約410mm×480mm的樣本面積底部距相機1100毫米的距離

頂視-側視版本:約450mmx 450mm(距頂部攝像頭1000mm,側面攝像頭距離1200mm

重量

臺式版本:60kg;立柜式版本:100kg;頂視-側視版本:200kg

控制

帶觸摸面板的集成式PC(頂視版本)或專用PC(用于頂視-側視版本)

軟件

過程控制,圖像采集,數據導出,數據處理


軟件功能

LemnaTec OS是一個用于植物,種子和小型生物體表型分析的完整軟件系統。 一套集成模塊可自動完成表型分型過程并分析所得圖像。 LemnaTec OS提供API來集成第三方產品,包括傳感器,傳送帶,照明系統和軟件。 復雜的程序可以快速簡便地自動執行,并且系統能夠處理大量的圖像和數據。

blob.png

  • 控制植物盆栽和傳感器的移動

  • 計劃并執行澆水,噴淋和成像的程序

  • 用于集成各種傳感器的API

  • 用于非LemnaTec設備的可編程接口

  • 集中數據采集

blob.png

  • 用于詳細圖像分析與處理

  • 廣泛的圖像格式

  • 圖像處理算法庫,包括高光譜數據

  • 用于集成第三方圖像處理軟件的API

LEMNA-R

  • 通過plotting功能輕松訪問所有數據

  • R語言無縫集成

  • 可配置的數據處理功能

  • 數據和圖像的可視化

  • 報告生成器

blob.png

  • 服務器或PC上的數據庫管理

  • 具有完整文檔的開放數據庫訪問權限

  • 圖像,數據和分析的圖形顯示

  • 植物和傳感器的位置數據

 

應用實例

u  擬南芥形態學分析


通過對擬南芥的可見光成像,可以分析各種形態學參數。



blob.png

對稱性分析

blob.png

緊密性(Compactness)分析


blob.png

直徑測量





blob.png

最大葉長


blob.png

葉片 Center of Mass


blob.png

可視化二階距(Second moments visualization)



u  種子真菌感染分析

即使利用基礎型成像系統 Lab Scanalyer也可以對種子進行高通量分析,獲得詳細的形態、顏色信息,進行生理、病理診斷。如下圖就是對通過成像分析麥粒的真菌感染情況

blob.png


收 藏
排列三近100期历史开奖